Эдди и Веном, после событий второго фильма, оказываются в центре всеобъемлющего преследования. Злодей Налл, создатель симбиотов, решает вернуть Венома, чтобы активировать важнейший артефакт — Кодекс, который может освободить его. Но чтобы артефакт заработал, симбиот и его хозяин должны остаться в безопасности. Это ставит героев в сложное положение, ведь на них охотятся не только преступники, но и правительственные организации.
Кроме того, полиция обвиняет Эдди в убийстве детектива Маллигана, что осложняет их положение. В этот момент к преследованию подключаются спецслужбы из Зоны 51, которые действуют под руководством ученой Тедди Пейн и военного Рекса Стрикленда. В результате Эдди и Веном оказываются в настоящем смертельном противостоянии, где каждый шаг может стать последним, а их судьба зависит от того, смогут ли они сохранить свою жизнь и секрет Кодекса.